Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGAP28Q9P2N2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARHGAP28Q9P2N2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARHGAP28Q9P2N2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms