Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC48.19■■■■■ 5.31
CCDC180Q9P1Z9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC48.19■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC48.15■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC48.14■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC48.13■■■■■ 5.3
CCDC180Q9P1Z9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC48.11■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC48.11■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC48.08■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC48.07■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC48.07■■■■■ 5.29
CCDC180Q9P1Z9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC48.04■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC48.04■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC48.03■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC48.03■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC48.03■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.03■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC48.02■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC48.01■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.01■■■■■ 5.28
CCDC180Q9P1Z9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC48■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC47.99■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
CCDC180Q9P1Z9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms