Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PODXL2Q9NZ53 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PODXL2Q9NZ53 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PODXL2Q9NZ53 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms