Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCM2LQ9NUG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCM2LQ9NUG4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms