Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
DUOX2Q9NRD8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
DUOX2Q9NRD8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
DUOX2Q9NRD8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
DUOX2Q9NRD8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms