Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NRIP3Q9NQ35 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NRIP3Q9NQ35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NRIP3Q9NQ35 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms