Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRC4Q9NPP4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRC4Q9NPP4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRC4Q9NPP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms