Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

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Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPRHQ9HD43 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRHQ9HD43 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRHQ9HD43 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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