Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BRMS1Q9HCU9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRMS1Q9HCU9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms