Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POPDC3Q9HBV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC3Q9HBV1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms