Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR1BQ9H9Y6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR1BQ9H9Y6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms