Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ELP3Q9H9T3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ELP3Q9H9T3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ELP3Q9H9T3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms