Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYNPO2LQ9H987 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNPO2LQ9H987 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNPO2LQ9H987 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms