Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NRDE2Q9H7Z3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRDE2Q9H7Z3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms