Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B2

RPF2, Ribosome production factor 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF2Q9H7B2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RPF2Q9H7B2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPF2Q9H7B2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms