Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RWDD1Q9H446 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RWDD1Q9H446 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RWDD1Q9H446 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms