Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP44Q9H0E7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP44Q9H0E7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP44Q9H0E7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms