Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TGIF2Q9GZN2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms