Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCSER1Q9C0I3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCSER1Q9C0I3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCSER1Q9C0I3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
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