Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ZC3H12CQ9C0D7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZC3H12CQ9C0D7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms