Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE2OQ9C0C9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE2OQ9C0C9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE2OQ9C0C9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms