Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CIPCQ9C0C6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CIPCQ9C0C6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CIPCQ9C0C6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms