Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CNTNAP4Q9C0A0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CNTNAP4Q9C0A0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms