Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
INO80BQ9C086 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
INO80BQ9C086 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms