Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RNF17Q9BXT8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RNF17Q9BXT8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RNF17Q9BXT8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RNF17Q9BXT8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms