Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWU1

CDK19, Cyclin-dependent kinase 19, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK19Q9BWU1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK19Q9BWU1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CDK19Q9BWU1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CDK19Q9BWU1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CDK19Q9BWU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms