Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SELENOOQ9BVL4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SELENOOQ9BVL4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms