Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC61Q9BV99 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC61Q9BV99 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC61Q9BV99 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC61Q9BV99 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms