Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MKNK1Q9BUB5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MKNK1Q9BUB5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MKNK1Q9BUB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms