Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC1Q9BTT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC1Q9BTT6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC1Q9BTT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms