Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM175Q9BSA9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM175Q9BSA9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM175Q9BSA9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms