Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
FYCO1Q9BQS8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
FYCO1Q9BQS8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms