Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BPIFA3Q9BQP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BPIFA3Q9BQP9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BPIFA3Q9BQP9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms