Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DUSP9Q99956 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUSP9Q99956 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms