Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MEIS3Q99687 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MEIS3Q99687 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
MEIS3Q99687 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms