Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD9AQ99638 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAD9AQ99638 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD9AQ99638 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms