Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSRNP1Q96S65 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSRNP1Q96S65 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSRNP1Q96S65 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms