Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPS6KC1Q96S38 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RPS6KC1Q96S38 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPS6KC1Q96S38 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms