Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

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Length 5,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
HMCN1Q96RW7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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HMCN1Q96RW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
HMCN1Q96RW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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