Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED4Q96RK1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED4Q96RK1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CITED4Q96RK1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CITED4Q96RK1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CITED4Q96RK1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CITED4Q96RK1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms