Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB3IPQ96QF0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms