Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF3Q96PU9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF3Q96PU9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms