Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PGLYRP2Q96PD5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PGLYRP2Q96PD5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PGLYRP2Q96PD5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms