Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCLT1Q96NL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCLT1Q96NL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCLT1Q96NL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCLT1Q96NL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCLT1Q96NL6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCLT1Q96NL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCLT1Q96NL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCLT1Q96NL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms