Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC74BQ96LY2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC74BQ96LY2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms