Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC17Q96LX7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC17Q96LX7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC17Q96LX7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms