Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM47Q96LD4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM47Q96LD4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms