Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SGCZQ96LD1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SGCZQ96LD1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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