Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDLIM2Q96JY6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDLIM2Q96JY6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDLIM2Q96JY6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms