Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAX2Q96IS3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAX2Q96IS3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAX2Q96IS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms